Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTTNBP2Q8WZ74 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms