Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAAF4Q8WXU2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAAF4Q8WXU2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms