Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APTXQ7Z2E3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms