Protein–RNA interactions for Protein: Q70UQ0

IKBIP, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBIPQ70UQ0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IKBIPQ70UQ0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms