Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC149Q6ZUS6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms