Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MED27Q6P2C8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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