Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms