Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4orf17Q53FE4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4orf17Q53FE4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms