Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC57Q2TAC2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC57Q2TAC2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms