Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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GEN1Q17RS7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
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GEN1Q17RS7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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GEN1Q17RS7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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GEN1Q17RS7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
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GEN1Q17RS7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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GEN1Q17RS7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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GEN1Q17RS7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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