Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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RTL8BQ17RB0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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RTL8BQ17RB0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RTL8BQ17RB0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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