Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DDR2Q16832 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms