Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NTRK3Q16288 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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