Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VAMP3Q15836 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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