Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCLAFQ15004 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCLAFQ15004 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms