Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHPRHQ149N8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHPRHQ149N8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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