Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERV3-1Q14264 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms