Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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