Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RUNX3Q13761 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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