Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CUL4AQ13619 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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