Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TOP3AQ13472 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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