Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCGQ13326 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SGCGQ13326 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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