Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
SRSF5Q13243 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SRSF5Q13243 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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