Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PRDM2Q13029 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
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