Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms