Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CNTN1Q12860 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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