Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LOXL1Q08397 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LOXL1Q08397 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LOXL1Q08397 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LOXL1Q08397 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LOXL1Q08397 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LOXL1Q08397 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LOXL1Q08397 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LOXL1Q08397 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LOXL1Q08397 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LOXL1Q08397 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LOXL1Q08397 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms