Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC3A1Q07837 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms