Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PDE4BQ07343 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE4BQ07343 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms