Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FMODQ06828 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms