Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EXOSC9Q06265 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms