Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC18A2Q05940 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms