Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NHLH2Q02577 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms