Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACTG1P63261 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms