Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HERVK_113P62684 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms