Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COPZ1P61923 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms