Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBASH3AP57075 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UBASH3AP57075 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms