Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAV3P56539 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAV3P56539 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAV3P56539 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAV3P56539 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CAV3P56539 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAV3P56539 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAV3P56539 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAV3P56539 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAV3P56539 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAV3P56539 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CAV3P56539 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAV3P56539 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms