Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP12AP54707 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP12AP54707 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms