Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EMDP50402 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EMDP50402 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EMDP50402 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMDP50402 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMDP50402 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMDP50402 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMDP50402 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMDP50402 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMDP50402 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms