Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A3P48764 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms