Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RANGAP1P46060 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms