Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGFBR1P36897 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms