Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA3P32297 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA3P32297 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms