Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CLIP1P30622 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLIP1P30622 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms