Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GJB2P29033 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GJB2P29033 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms