Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD34P28906 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CD34P28906 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CD34P28906 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CD34P28906 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CD34P28906 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CD34P28906 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CD34P28906 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD34P28906 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD34P28906 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms