Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
IL3RAP26951 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms