Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ITGA3P26006 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA3P26006 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms