Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5A1P25705 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms